无处不在的微生物，对有机化合物有强大的分解能力，是大自然的清洁工，被誉为“天然环境卫士”。可以想象，如果没有微生物，地球上的动植物残体将会堆积如山，挤占人类的生存空间，让人类没有立足之地。于是，以微生物为载体制成的农用微生物制剂，被广泛用于治理土壤污染。
微生物以污染物为食
许多微生物“以污染物为食”，如碳水化合物类污染物、蛋白质类污染物和脂肪类污染物都能被各种微生物分解，成为它们生长的能量。利用微生物解决环境污染有巨大发展潜力，越来越多的人开始专注开发环保用微生物菌剂。以活的有益微生物为主要指标、用于农业生产和治理土壤污染的制剂被定义为微生物肥料，现在，微生物肥料已经大规模的应用于治理土壤治污。
这种微生物肥料是由一种或多种微生物组合或混合培养制成的产品，通过它们的生长代谢将污染物降解，达到净化效果。由于大多数污染物都需要几种微生物一起发挥作用，所以复合微生物肥料的应用较多。其中有一种基因工程菌，是将多种微生物的降解性基因从细胞中分离出来，组装到一个细胞中，使其集多种微生物的降解功能于一身，可以同时降解多种污染物，“相当于转基因”。
微生物肥料在治理土壤污染方面主要有以下三方面的作用：
一、是微生物通过代谢将污染物氧化分解为二氧化碳和水等终产物，或转化为微生物和植物的营养物质，比如光合细菌和芽孢杆菌等，能将恶臭气体硫化氢转化成自身生长所需要的硫元素。
二、是有的微生物含有多糖类黏性物质，可以吸附环境中的污染物。刘志恒强调，我国土壤重金属污染形势严峻，利用微生物吸附重金属离子，是目前有发展前景的治污方法之一。
三、是把微生物肥料施入土壤后，有益微生物就成为土壤环境中的优势菌，能抑制病原菌和腐败菌的生长。
把各种功能的微生物组合在一个产品中，使其既有降解土壤污染作用，又有促进生长的作用，还有刺激生根生长作用，达到一肥多用的功效，这样的微生物肥料受欢迎。金宝贝微生物菌肥就是这样一类微生物肥料。
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